在抗战期间，除教书育人外，原南开经济学系的教师们还出版和发表了很多优秀的研究成果。例如，方显廷，除指导经济研究所的研究生外，在抗战的八年中，仅专著一类就有：《中国经济研究》（上下册，1938年商务印书馆出版）《战时中国经济研究》（1941年9月商务印书馆出版）《战后中国工业化》（英文本，1942年4月）《中国战时物价与生产》（1945年商务印书馆正在印刷中）《战后中国经济问题研究》（1945年商务印书馆，正在印刷中）《太平洋各国经济问题》（1945年4月商务印书馆）等六本书出版，单行本的专论还有很多种。各种刊物上发表的学术论文有几十篇。再如，陈序经既担任教学，又兼职法商学院院长等行政职务，在抗战期间也出版了两本专著：《暹罗与华侨》《疍民之研究》，均于1941年由商务印书馆出版发行。

经济研究所在重庆的研究工作主要侧重于七个方面：战时中国通货膨胀研究；中国农业经济研究；战后中国经济建设研究；中国经济史研究；各种指数编制；社会与文化问题研究；大学教材编写等。

在研究的同时，西南联大的师生也在不断进行着反对日本侵略、反对国民党反动派的斗争。1939年，中共联大党支部在中共中央南方局与云南省工委的领导下秘密成立。据不完全统计，到1941年1月，联大已有党员86人，这些学生党员一边读书求学，一边在党的领导下贯彻中共中央坚持抗战、爱国、民主的各项主张，使西南联大成为大后方的“民主堡垒”。

伴随着中国人民抗日战争的胜利，西南联合大学宣告结束。在八年的时间里，它不仅为国家培养了众多的革命志士和各种优秀人才，为科学教育事业的发展做出了巨大的贡献，而且在救亡图存、争取民族解放、争取人民民主和社会进步的斗争中所建立的功绩，也在中国近代教育史上写下了光辉的一页。

 南开大学经济学科的教师和学生同全校的师生员工一样，与西南联大相始相终。在极其艰难的岁月里，不仅为国家培养了众多的经济人才，出色地完成了自己肩负的使命，而且在爱国民主运动中也走在了斗争的最前列，成为这一运动的中坚力量。作为经济系的学生和联大地下党支部书记、总支书记的袁永熙，就是他们的优秀代表。法商学院院长陈序经，抵制反动当局的诱惑，不怕威胁，受到人们的普遍好评。这既是南开教师的光荣，也使南开的经济学人感到骄傲和自豪。